1. 劣質晶化劑(又稱結晶劑)易殘留於大理石，造成餘害。
2. 處理不當，可能導致大理石表面色澤及紋路偏離原有狀態，造成色差。
3. 不乾淨的大理石表面會造成光澤不均。
4. 晶化劑屬酸性，會與大理石產生化學反應，需經專業操作使用，以免傷害大理石。
5. 晶化層會影嚮大理石呼吸的毛細孔，施工前需諮詢專業公司，以免日後造成大理石病變等問題。
6. 不專業的處理容易導致大理石燒傷或其他不可預期的現象。
7. 晶化處理後亦對酸性液體等傷害性物質並不具較佳的抵抗性，需特別注意。
8. 晶化劑之成份並不一定適合所有大理石，有些大理石特別容易燒傷且嚴重燒傷後不易復原。
9. 若化學反應處理不完全，其表層硬度反而比原碳酸鈣低。
10.不當藥劑處理，會對大理石造成永久性的傷害(龜裂、鈣化等)